Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1507-203ENSMUST00000206062 2803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12719-201ENSMUST00000118859 241 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Tpt1-ps3-201ENSMUST00000121046 519 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12708-201ENSMUST00000126143 349 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11775-201ENSMUST00000136500 773 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28612-201ENSMUST00000189214 416 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Steap2-204ENSMUST00000115426 10408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv11-106-201ENSMUST00000103331 346 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29428-201ENSMUST00000190086 409 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32444-201ENSMUST00000195147 3511 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Calml4-203ENSMUST00000213643 710 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23789-201ENSMUST00000122536 301 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms