Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa13Q62424 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa13Q62424 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa13Q62424 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa13Q62424 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa13Q62424 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa13Q62424 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa13Q62424 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa13Q62424 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa13Q62424 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa13Q62424 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxa13Q62424 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxa13Q62424 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxa13Q62424 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxa13Q62424 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxa13Q62424 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxa13Q62424 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxa13Q62424 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxa13Q62424 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxa13Q62424 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxa13Q62424 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxa13Q62424 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms