Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 P2ry14-205ENSMUST00000197220 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 AC153971.2-201ENSMUST00000214553 777 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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Tmem253Q3UNB8 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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Tmem253Q3UNB8 AC144798.1-201ENSMUST00000228120 391 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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Tmem253Q3UNB8 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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Tmem253Q3UNB8 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm12880-201ENSMUST00000120652 494 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm11692-201ENSMUST00000122121 902 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tmem253Q3UNB8 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms