Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 AC130547.1-201ENSMUST00000228079 1047 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Trim71Q1PSW8 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms