Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm44376-201ENSMUST00000197570 128 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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Rpusd3Q14AI6 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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Rpusd3Q14AI6 Olfr905-202ENSMUST00000214377 4429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
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Rpusd3Q14AI6 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Gm43913-201ENSMUST00000203924 3029 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Trappc13-205ENSMUST00000144060 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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Rpusd3Q14AI6 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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Rpusd3Q14AI6 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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Rpusd3Q14AI6 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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Rpusd3Q14AI6 Rgs5-201ENSMUST00000027997 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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Rpusd3Q14AI6 Olfr741-201ENSMUST00000071932 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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Rpusd3Q14AI6 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Gm21119-201ENSMUST00000178438 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Cd28-201ENSMUST00000027165 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Rpusd3Q14AI6 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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