Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm43198-201ENSMUST00000200927 326 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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Hoxd13P70217 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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