Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm15643-201ENSMUST00000126556 383 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr613-202ENSMUST00000214173 3840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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Sh3bp1P55194 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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Sh3bp1P55194 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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Sh3bp1P55194 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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Sh3bp1P55194 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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Sh3bp1P55194 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sh3bp1P55194 Psg25-201ENSMUST00000094795 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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