Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VdrP48281 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
VdrP48281 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
VdrP48281 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
VdrP48281 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VdrP48281 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
VdrP48281 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
VdrP48281 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
VdrP48281 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
VdrP48281 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
VdrP48281 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
VdrP48281 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
VdrP48281 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
VdrP48281 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
VdrP48281 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
VdrP48281 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
VdrP48281 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
VdrP48281 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
VdrP48281 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
VdrP48281 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
VdrP48281 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
VdrP48281 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
VdrP48281 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
VdrP48281 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
VdrP48281 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms