Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Olfr741-201ENSMUST00000071932 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 4932438A13Rik-217ENSMUST00000152564 15541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PdgfraP26618 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms