Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Vmn2r-ps35-201ENSMUST00000169206 831 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
P10404 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
P10404 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
P10404 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
P10404 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
P10404 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
P10404 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
P10404 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
P10404 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
P10404 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
P10404 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
P10404 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
P10404 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
P10404 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
P10404 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
P10404 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
P10404 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
P10404 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
P10404 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
P10404 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
P10404 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
P10404 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
P10404 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
P10404 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
P10404 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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