Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm38152-201ENSMUST00000195389 3566 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm14500-201ENSMUST00000121647 113 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Has2os-203ENSMUST00000165880 638 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm37601-201ENSMUST00000194922 394 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Dync2h1-204ENSMUST00000140466 14264 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm38057-201ENSMUST00000195551 3203 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Mbnl1-219ENSMUST00000194201 4319 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm43735-201ENSMUST00000198245 809 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm40477-202ENSMUST00000221505 881 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Olfr393-202ENSMUST00000213365 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm28362-201ENSMUST00000189430 2420 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Olfr32-205ENSMUST00000215659 2998 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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