Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28702-201ENSMUST00000188276 253 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18442-201ENSMUST00000220925 639 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC183096.1-201ENSMUST00000226392 130 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr414-202ENSMUST00000192358 4526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl26-ps5-201ENSMUST00000122220 439 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8823-201ENSMUST00000193158 433 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44650-201ENSMUST00000206929 194 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23099-201ENSMUST00000083454 139 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms