Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm7449-201ENSMUST00000194393 663 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Cntn6-205ENSMUST00000162872 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm22269-201ENSMUST00000104002 130 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Olfr660-ps1-201ENSMUST00000121526 375 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Znrd1-201ENSMUST00000113669 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 AC119241.1-201ENSMUST00000223651 534 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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Col5a3Q9JLI2 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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Col5a3Q9JLI2 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm22453-201ENSMUST00000122801 318 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Col5a3Q9JLI2 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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