Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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Sgo1Q9CXH7 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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Sgo1Q9CXH7 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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Sgo1Q9CXH7 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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Sgo1Q9CXH7 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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Sgo1Q9CXH7 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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Sgo1Q9CXH7 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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Sgo1Q9CXH7 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sgo1Q9CXH7 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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