Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Traj59-202ENSMUST00000197589 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1307-201ENSMUST00000099604 15582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms