Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Olfr1235-ps1-201ENSMUST00000117898 314 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm28263-201ENSMUST00000185884 400 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Olfr580-ps1-201ENSMUST00000210528 943 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tsr1Q5SWD9 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms