Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
RxraP28700 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
RxraP28700 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
RxraP28700 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.57
RxraP28700 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm5924-201ENSMUST00000132554 871 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 CT573422.1-201ENSMUST00000216655 405 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms