Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm28702-201ENSMUST00000188276 253 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm43604-201ENSMUST00000199799 705 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 AC156790.5-201ENSMUST00000227075 231 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 AC126673.1-201ENSMUST00000223208 3856 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm45697-201ENSMUST00000212893 2876 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Olfr606-201ENSMUST00000098200 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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Hoxd10P28359 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 1700112M02Rik-201ENSMUST00000221719 348 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Hoxd10P28359 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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