Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Hm629797-201ENSMUST00000183645 2398 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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Ccl20O89093 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm43635-201ENSMUST00000202533 352 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Cysltr1-202ENSMUST00000113480 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm38235-201ENSMUST00000194600 4952 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Tenm1-203ENSMUST00000115059 12879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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Ccl20O89093 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
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Ccl20O89093 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 AC164437.2-201ENSMUST00000228915 797 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Mir202-201ENSMUST00000083568 72 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Vmn1r185-212ENSMUST00000228633 5385 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Ccl20O89093 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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