Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Opn1mwO35599 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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