Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm25386-201ENSMUST00000157814 288 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm22536-201ENSMUST00000158171 134 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Mir551b-201ENSMUST00000102165 98 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Ighv1-77-201ENSMUST00000170551 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms