Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm13471-201ENSMUST00000122057 433 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Fbxw14-201ENSMUST00000112041 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm3835-201ENSMUST00000120752 403 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm23269-201ENSMUST00000178701 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Mrgprb12-ps-201ENSMUST00000186150 949 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms