Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm23424-201ENSMUST00000103889 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm24517-201ENSMUST00000122560 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr612-202ENSMUST00000214269 2420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms