Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 AC154548.1-201ENSMUST00000225844 3838 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Olfr112-204ENSMUST00000208832 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Gm24281-201ENSMUST00000104234 136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Klrc1-201ENSMUST00000032270 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Gm6902-202ENSMUST00000191169 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Cfap46-202ENSMUST00000129990 8180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Szt2-201ENSMUST00000075406 10965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Polr1a-201ENSMUST00000055296 9216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SacsQ9JLC8 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Gm25272-201ENSMUST00000104293 128 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Gm29774-201ENSMUST00000219270 436 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 AC160865.1-201ENSMUST00000219873 151 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Hook3-201ENSMUST00000037182 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Gm37478-201ENSMUST00000193624 3495 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Gm14500-201ENSMUST00000121647 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Sptbn1-203ENSMUST00000102838 9107 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Zhx3-202ENSMUST00000103112 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Muc4-201ENSMUST00000096106 11277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Olfr125-202ENSMUST00000213857 3835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SacsQ9JLC8 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms