Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Olfr397-202ENSMUST00000213134 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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