Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm28190-201ENSMUST00000189766 722 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm24517-201ENSMUST00000122560 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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