Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ddb2Q99J79 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms