Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm14172-201ENSMUST00000118255 644 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 Mir3104-201ENSMUST00000174911 63 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc71Q8VEG0 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Gm12190-201ENSMUST00000120001 187 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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Ccdc71Q8VEG0 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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Ccdc71Q8VEG0 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc71Q8VEG0 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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