Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
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Trim35Q8C006 Gm23358-201ENSMUST00000103887 110 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm14056-201ENSMUST00000117198 642 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm12034-201ENSMUST00000119032 399 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm15941-204ENSMUST00000135401 726 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm16031-201ENSMUST00000153253 448 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 U2af1l4-205ENSMUST00000163482 668 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm43518-201ENSMUST00000166129 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm29145-201ENSMUST00000189914 456 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm37371-201ENSMUST00000194837 392 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Ocm-202ENSMUST00000085704 330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Syne1-202ENSMUST00000095899 3443 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 A730085K08Rik-201ENSMUST00000177015 2013 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Nol4-202ENSMUST00000081423 3309 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
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Trim35Q8C006 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Trim35Q8C006 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Trim35Q8C006 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Trim35Q8C006 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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Trim35Q8C006 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Trim35Q8C006 Slfn5-202ENSMUST00000108157 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm12378-201ENSMUST00000116171 1461 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm1988-201ENSMUST00000188190 2565 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim35Q8C006 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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