Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NischQ80TM9 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NischQ80TM9 Gm2974-201ENSMUST00000164512 1990 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NischQ80TM9 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NischQ80TM9 0610010F05Rik-201ENSMUST00000043356 4392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NischQ80TM9 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NischQ80TM9 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NischQ80TM9 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
NischQ80TM9 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
NischQ80TM9 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
NischQ80TM9 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
NischQ80TM9 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
NischQ80TM9 Vmn1r42-202ENSMUST00000226436 4045 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Olfr1490-201ENSMUST00000080162 951 ntAPPRIS P2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm5416-201ENSMUST00000089628 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm40477-202ENSMUST00000221505 881 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm14784-201ENSMUST00000121604 663 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Olfr769-202ENSMUST00000215453 4143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm19774-201ENSMUST00000190667 114 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm15263-201ENSMUST00000121556 642 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Olfr151-201ENSMUST00000211893 1128 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Olfr168-201ENSMUST00000078554 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Olfr1507-203ENSMUST00000206062 2803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NischQ80TM9 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
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