Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Nell1os-203ENSMUST00000152166 410 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27611-201ENSMUST00000184690 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Ccdc88cQ6VGS5 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Ccdc88cQ6VGS5 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Ccdc88cQ6VGS5 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1197-202ENSMUST00000213118 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Ank2-208ENSMUST00000182078 14305 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps2-201ENSMUST00000121053 765 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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