Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm24586-201ENSMUST00000116695 89 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm14541-201ENSMUST00000118985 157 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm29327-201ENSMUST00000188229 388 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm45209-201ENSMUST00000207122 353 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm5938-201ENSMUST00000114030 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 AC155237.2-201ENSMUST00000228487 478 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms