Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 AC166358.4-201ENSMUST00000223030 105 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm25821-201ENSMUST00000093657 133 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Olfr414-202ENSMUST00000192358 4526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm38125-201ENSMUST00000194136 3438 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Olfr741-201ENSMUST00000071932 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm12760-201ENSMUST00000117861 482 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm14784-201ENSMUST00000121604 663 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Cpne9Q1RLL3 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.4 ms