Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Neto2-201ENSMUST00000109686 5610 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 AC133189.1-201ENSMUST00000198820 140 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm44879-201ENSMUST00000207007 503 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm37397-201ENSMUST00000194579 2842 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms