Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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Hoxd13P70217 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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Hoxd13P70217 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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Hoxd13P70217 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd13P70217 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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