Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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NcstnP57716 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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NcstnP57716 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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NcstnP57716 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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NcstnP57716 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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NcstnP57716 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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NcstnP57716 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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NcstnP57716 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NcstnP57716 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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NcstnP57716 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NcstnP57716 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NcstnP57716 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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