Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm37733-201ENSMUST00000195478 2962 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm7195-201ENSMUST00000190869 1707 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr112-204ENSMUST00000208832 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm23960-201ENSMUST00000157206 131 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr388-ps1-201ENSMUST00000118336 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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