Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 2610044O15Rik8-206ENSMUST00000191043 504 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VdrP48281 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VdrP48281 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
VdrP48281 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
VdrP48281 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
VdrP48281 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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VdrP48281 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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VdrP48281 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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VdrP48281 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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VdrP48281 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VdrP48281 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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VdrP48281 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VdrP48281 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VdrP48281 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VdrP48281 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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VdrP48281 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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VdrP48281 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
VdrP48281 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VdrP48281 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
VdrP48281 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VdrP48281 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
VdrP48281 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VdrP48281 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
VdrP48281 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
VdrP48281 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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