Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 AC166358.4-201ENSMUST00000223030 105 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr1458-202ENSMUST00000215160 1914 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms