Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm18423-201ENSMUST00000205144 1074 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm30198-201ENSMUST00000222873 824 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Adgrl3-211ENSMUST00000120128 6370 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 AC126690.1-201ENSMUST00000228898 397 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd8P23463 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms