Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
P10404 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
P10404 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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