Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Crem-219ENSMUST00000140332 1015 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm25447-201ENSMUST00000158997 128 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm42616-201ENSMUST00000198989 4184 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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Ccl20O89093 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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Ccl20O89093 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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Ccl20O89093 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
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