Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm7646-201ENSMUST00000198590 1346 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm14506-201ENSMUST00000121165 536 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1001-ps1-201ENSMUST00000121340 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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Hdac6Q9Z2V5 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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Hdac6Q9Z2V5 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm36485-201ENSMUST00000214286 464 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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Hdac6Q9Z2V5 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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Hdac6Q9Z2V5 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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Hdac6Q9Z2V5 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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Hdac6Q9Z2V5 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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Hdac6Q9Z2V5 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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Hdac6Q9Z2V5 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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Hdac6Q9Z2V5 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm29950-201ENSMUST00000195273 237 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm25404-201ENSMUST00000082970 107 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
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