Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm37209-201ENSMUST00000194109 1276 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms