Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Ube3bQ9ES34 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Ube3bQ9ES34 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ube3bQ9ES34 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ube3bQ9ES34 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Ube3bQ9ES34 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ube3bQ9ES34 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ube3bQ9ES34 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ube3bQ9ES34 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ube3bQ9ES34 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ube3bQ9ES34 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ube3bQ9ES34 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Ube3bQ9ES34 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ube3bQ9ES34 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Ube3bQ9ES34 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Ube3bQ9ES34 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Ube3bQ9ES34 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ube3bQ9ES34 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ube3bQ9ES34 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ube3bQ9ES34 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ube3bQ9ES34 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ube3bQ9ES34 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ube3bQ9ES34 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ube3bQ9ES34 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms