Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Pih1h3b-201ENSMUST00000044806 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AC153382.1-201ENSMUST00000217953 1007 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Dach2-202ENSMUST00000113378 2089 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm11260-201ENSMUST00000121163 942 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RpainQ9CWY9 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms