Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm37270-201ENSMUST00000194277 330 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms