Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm43188-201ENSMUST00000200180 2160 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm29320-201ENSMUST00000185235 615 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm29179-202ENSMUST00000186138 615 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm28598-201ENSMUST00000186490 615 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm29448-201ENSMUST00000186675 615 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm29314-201ENSMUST00000186800 615 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm28253-202ENSMUST00000187971 615 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm29268-201ENSMUST00000188669 615 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm29169-201ENSMUST00000189835 615 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm29218-205ENSMUST00000190846 615 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm28978-201ENSMUST00000191120 615 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm37172-201ENSMUST00000191926 615 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Traj59-202ENSMUST00000197589 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sh3bp1P55194 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms