Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Vmn2r-ps67-201ENSMUST00000172624 385 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
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PtpreP49446 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
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PtpreP49446 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
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PtpreP49446 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PtpreP49446 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
PtpreP49446 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
PtpreP49446 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
PtpreP49446 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PtpreP49446 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PtpreP49446 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PtpreP49446 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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