Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprkP35822 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprkP35822 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm45507-201ENSMUST00000210611 519 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprkP35822 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PtprkP35822 0610010F05Rik-202ENSMUST00000093267 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprkP35822 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Olfr1109-201ENSMUST00000099863 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprkP35822 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Olfr1377-203ENSMUST00000216101 1990 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprkP35822 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm25965-201ENSMUST00000157170 93 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprkP35822 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprkP35822 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprkP35822 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm38125-201ENSMUST00000194136 3438 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprkP35822 AC154677.1-201ENSMUST00000227636 2805 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Olfr660-ps1-201ENSMUST00000121526 375 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Spin2-ps4-201ENSMUST00000126395 762 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Spin2-ps3-201ENSMUST00000148147 762 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm46998-201ENSMUST00000221444 330 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprkP35822 AC140344.1-201ENSMUST00000223384 387 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprkP35822 AC187103.4-202ENSMUST00000225091 230 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprkP35822 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprkP35822 A430106G13Rik-201ENSMUST00000182158 3388 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm5757-201ENSMUST00000117494 528 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm13985-201ENSMUST00000154409 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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